魔法配方漫画讲述了传说中带来乾枯的大地魔力的大陨石落下，之后经过相当长的时间...而将其当作历史开始的「普拉琳奈教」在陨石坠落的地方建立人类最大知识的宝库——魔法大学！某天，天才少女拿伊普因生病而必须离开大学，感觉就像是为了填补空缺似地，一名来路不明的少年史卜恩卡司泰进入了魔法大学...